新疆医科大学是一所实力较强的医药类院校，在全国有一定认可度，但在内地认可度可能受地域等因素影响。从综合实力来看，它是省重点高校，拥有保研资格，入选了卓越医生、卓越医生（中医）计划。在各类排名中表现不错，如2025软科中国大学排名第208位，校友会2025年中国大学排名第225位，软科2024年医药类排名第32位。
新疆医科大学：由于其地理位置和学科特色，新疆医科大学毕业生在西北地区尤其是新疆地区的医疗机构中具有较高的认可度。该校毕业生在就业市场上具有较强的竞争力，特别是在临床医学、护理学等专业领域。石河子大学医学院：作为211大学的医学院，其毕业生在就业市场上同样具有较大的优势。
所以，新疆医科大学属于全国认可度较高的中档好大学。学科评级：新疆医科大学有6个学科进入了教育部全国第四轮学科评级榜单中，取得的最好学科成绩为B-，其所对应的学科为药学。教育部的这个学科评级榜单中，不少大学的学科连评级的资格都没有。所以新疆医科大学能取得这样的成绩，已经算是非常不错了。
总的来说，新疆医科大学在当地的评价还是不错的，学校致力于提升教学质量，加强科研能力，为学生提供了良好的学习环境和职业前景。对于有志于在新疆地区从事医学事业的学生来说，新疆医科大学是一个值得考虑的选择。
年新疆维吾尔自治区大学排名因评价机构不同而有所差异。软科排名：新疆大学位居榜首，全国排名127位。石河子大学排名第二，全国排名140位。新疆医科大学排名第三，全国排名208位。新疆农业大学排名第四，全国排名299位。塔里木大学排名第五，全国排名318位。新疆师范大学排名第六，全国排名335位。
年综合排名（含本专科，63所完整版）此排名中，新疆大学雄居首位，石河子大学位居第2，新疆医科大学位居第3 ，但未公布完整63所学校排名内容。
石河子大学居第二，新疆医科大学排第三，新疆师范大学、新疆农业大学分列第第五，塔里木大学位居第六等。校友会2025新疆维吾尔自治区大学排名里，新疆大学位居首位，新疆医科大学排第二，石河子大学排第三。
石河子大学居第二，新疆医科大学排第三，新疆师范大学、新疆农业大学分列第第五，塔里木大学位居第六等。校友会2025新疆维吾尔自治区大学排名里，新疆大学位居首位，新疆医科大学排第二，石河子大学排第三。
年综合排名（含本专科，63所完整版）此排名中，新疆大学雄居首位，石河子大学位居第2，新疆医科大学位居第3 ，但未公布完整63所学校排名内容。
校友会给出的新疆本科院校排名如下：新疆大学：全国排名175，4★中国高水平大学，有马克思主义理论、化学、计算机科学与技术3个国家双一流建设学科，优势专业有电气工程及其自动化、数学与应用数学等。新疆医科大学：全国排名225，3★区域一流大学，优势学科是临床医学，特色学科有药学、中医学等。
市级学院有塔里木大学（1958年建校）。军校类有陆军边海防学院乌鲁木齐校区。2025校友会大学排名中，新疆本科院校排名依次为：新疆大学（4★中国高水平大学）、新疆医科大学（3★区域一流大学）、石河子大学（3★区域一流大学）、新疆农业大学（3★区域一流大学）、新疆师范大学（3★区域一流大学）等。
年新疆十大名校排行榜：新疆大学：新疆地区综合实力较强的高等学府，具有较高的学术影响力和社会知名度。专业设置广泛，师资力量雄厚，硬件设施完善。石河子大学：位于石河子市，是一所综合性大学，以农业、医学、理工科为特色。在国内外享有较高声誉，学术成果丰硕。
新疆2024学校办学实力强的二本大学有新疆农业大学、塔里木大学、喀什大学等，其办学实力不输一本院校，报考这些新疆二本性价比很高。新疆最好的二本大学排名第一的是新疆医科大学，排名第二位的是石河子大学，位居第三位的是新疆农业大学。详细的新疆实力强的二本盘点往下看吧。
中档次。排名：在2023软科中国大学排名中，新疆医科大学位于第228位；在校友会2023年中国大学排名中，新疆医科大学位于第159位；在中国科教网2023中国大学排名中，新疆医科大学位于第388位；综合国内多个大学排行榜的数据可知，新疆医科大学在全国的排名为159~388名之间，在全国2756所大学中排名靠前。
双非大学高档次。新疆医科大学是新疆唯一一所独立建制的医学院校，而且还是省部委共建高校、卓越医生教育培养计划项目试点高校、中国政府奖学金来华留学生接收院校，在双非大学当中的排名和地位较高，所以属于高档次的医学类院校。
新疆医科大学是一所在双非大学中档次较高的大学。无论是在全国高校中的排名，还是教育部学科评估等方面，新疆医科大学都有着相对不错的成绩。据软科2022中国大学排名：新疆医科大学排在全国第256名。据校友会2022中国大学排名：新疆医科大学排在全国第181名。
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